mutation

As funções utilizam decoradores do Numba para compilação Just-In-Time(JIT).

Contém funções que geram conjuntos de clones hipermutados a partir de vetores contínuos ou binários, simulando o processo de expansão clonal dos sistemas imunológicos artificiais.

Módulo: aisp.base.immune
Importação: from aisp.base.immune import mutation

Funções

clone_and_mutate_continuous

@njit([(types.float64[:], types.int64, types.float64)], cache=True)
def clone_and_mutate_continuous(
    vector: npt.NDArray[np.float64],
    n: int,
    mutation_rate: float
) -> npt.NDArray[np.float64]:
    ...

Gera um conjunto de clones mutados a partir de um vetor contínuo.

Esta função cria n clones do vetor de entrada e aplica mutações em cada um, simulando o processo de expansão clonal em sistemas imunes artificiais.

Parâmetros

Nome	Tipo	Padrão	Descrição
vector	npt.NDArray[np.float64]	-	Vetor contínuo original que representa a célula imune a ser clonada e mutada.
n	int	-	Quantidade de clones mutados que serão gerados.
mutation_rate	float	-	Se 0 ≤ mutation_rate < 1, usa probabilidade de mutação por características. Caso contrario, um número aleatorio de características é mutado.

Returns

Tipo	Descrição
npt.NDArray[np.float64]	Array com dimensões (n, len(vector)) contendo os n clones mutados do vetor original.

clone_and_mutate_binary

@njit([(types.boolean[:], types.int64, types.float64)], cache=True)
def clone_and_mutate_binary(
    vector: npt.NDArray[np.bool_],
    n: int,
    mutation_rate: float
) -> npt.NDArray[np.bool_]:
    ...

Gera um conjunto de clones mutados a partir de um vetor binário.

Esta função cria n clones do vetor binário de entrada e aplica mutações aos bits, simulando a expansão clonal em sistemas imunes artificiais com representações discretas.

Parâmetros

Nome	Tipo	Padrão	Descrição
vector	npt.NDArray[np.float64]	-	Vetor binário original que representa a célula imune a ser clonada e mutada.
n	int	-	Quantidade de clones mutados a serão gerados.
mutation_rate	float	-	Se 0 ≤ mutation_rate < 1, usa probabilidade de mutação por características. Caso contrario, um número aleatorio de características é mutado.

Returns

Tipo	Descrição
npt.NDArray[np.bool_]	Array com dimensões (n, len(vector)) contendo os n clones mutados do vetor original.

clone_and_mutate_ranged

@njit([(types.float64[:], types.int64, types.float64[:, :], types.float64)], cache=True)
def clone_and_mutate_ranged(
    vector: npt.NDArray[np.float64],
    n: int,
    bounds: npt.NDArray[np.float64],
    mutation_rate: float,
) -> npt.NDArray[np.float64]:
    ...

Gera um conjunto de clones mutados a partir de uma célula representada pelo intervalo personalizados por dimensão..

Esta função cria n clones do vetor de entrada e aplica mutações em cada um, simulando o processo de expansão clonal em sistemas imunes artificiais.

Parâmetros

Nome	Tipo	Padrão	Descrição
vector	npt.NDArray[np.float64]	-	Vetor contínuo original que representa a célula imune a ser clonada e mutada.
n	int	-	Quantidade de clones mutados a serão gerados.
bounds	np.ndarray	-	Array (n_features, 2) com valor mínimo e máximo por dimensão.
mutation_rate	float	-	Se 0 ≤ mutation_rate < 1, usa probabilidade de mutação por características. Caso contrario, um número aleatorio de características é mutado.

Returns

Tipo	Descrição
npt.NDArray[np.float64]	Array com dimensões (n, len(vector)) contendo os n clones mutados do vetor original.

clone_and_mutate_continuous

@njit([(types.int64[:], types.int64, types.float64)], cache=True)
def clone_and_mutate_permutation(
    vector: npt.NDArray[np.int64],
    n: int,
    mutation_rate: float
) -> npt.NDArray[np.int64]:
    ...

Gera um conjunto de clones com mutações por permutação.

Parâmetros

Nome	Tipo	Padrão	Descrição
vector	npt.NDArray[np.int64]	-	Vetor de permutação original que representa a célula imune a ser clonada e mutada.
n	int	-	Quantidade de clones mutados a serão gerados.
mutation_rate	float	-	Probabilidade de mutação de uma característica.

Returns

Tipo	Descrição
npt.NDArray[np.float64]	Array com dimensões (n, len(vector)) contendo os n clones mutados do vetor original.